Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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