Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Lrit3-202ENSMUST00000185462 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Dnttip2-201ENSMUST00000035776 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Tigar-201ENSMUST00000039913 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ccdc77-202ENSMUST00000112703 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Mpp2-202ENSMUST00000100398 3577 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Caps2-203ENSMUST00000170013 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Timeless-203ENSMUST00000105242 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Trim66-201ENSMUST00000033339 4354 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm22369-201ENSMUST00000102415 104 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm7609-202ENSMUST00000113407 853 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm13863-201ENSMUST00000118782 602 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm2076-201ENSMUST00000182524 971 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Prp2-201ENSMUST00000076061 1074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC154862.1-201ENSMUST00000225060 1763 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm10797-201ENSMUST00000099661 2222 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Rexo5-203ENSMUST00000106520 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Tgm5-201ENSMUST00000028721 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Wdr27-201ENSMUST00000170386 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Olfr412-202ENSMUST00000216362 1786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Kcnj10-201ENSMUST00000056136 5407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Hoxa2P31245 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms