Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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