Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RxraP28700 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms