Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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