Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RhoP15409 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RhoP15409 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
RhoP15409 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
RhoP15409 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
RhoP15409 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
RhoP15409 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RhoP15409 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms