Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Spocd1B1ASB6 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms