Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prr16A3KMN5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms