Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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