Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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