Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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