Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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