Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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