Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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