Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CipcQ8R0W1 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms