Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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