Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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