Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Actn1Q7TPR4 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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