Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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