Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms