Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms