Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Q3U6N9 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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