Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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