Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Grin2bQ01097 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms