Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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