Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VdrP48281 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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