Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms