Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd1P40201 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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