Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms