Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Kif3aP28741 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Kif3aP28741 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms