Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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