Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ggta1P23336 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms