Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atad2bE9Q166 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atad2bE9Q166 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms