Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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