Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms