Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp29Q9ES63 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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