Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Ccdc47Q9D024 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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Ccdc47Q9D024 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
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Ccdc47Q9D024 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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Ccdc47Q9D024 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc47Q9D024 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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