Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms