Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms