Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SynpoQ8CC35 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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