Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pcsk9Q80W65 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pcsk9Q80W65 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms