Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NischQ80TM9 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms