Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Trim17Q7TPM3 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim17Q7TPM3 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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