Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Shq1Q7TMX5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shq1Q7TMX5 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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