Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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