Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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