Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syne3Q4FZC9 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne3Q4FZC9 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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