Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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