Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms