Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms